障碍性贫血常见的临床症状为贫血、出血及感染。

    急性再生障碍性贫血患者发病急，病情重，进展迅速。贫血多呈进行性加重，乏力、头昏、面色苍白、心悸和气短等症状明显。慢性再生障碍性贫血患者大多起病缓，主要的症状常常是倦怠无力、劳累后气促、心悸、头晕、面色苍白等。
 
    出血：障碍性贫血患者均有程度不同的皮肤粘膜及内脏出血症状。皮肤出血表现为出血点或大片的瘀斑，口腔粘膜有小血泡；可有鼻衄、龈血、眼结合膜出血等。所有脏器都可有出血，但只有开口于外部的脏器出血才能为临床所查知。临床上可见呕血、便血、尿血，女性有阴道出血，其次为眼底出血和颅内出血，后者常危及患者生命。出血部位由少增多，有潜表转为内脏，常预兆会有更严重的出血。 

    感染：多数患者有发热，体温在38度以上，个别患者自发病到死亡均处于难以控制的的高温之中。以呼吸道感染最为常见，其他有消化道、泌尿生殖道及皮肤感染等。感染的菌种以革兰氏阴性杆菌、金黄色葡萄球菌和真菌为主，常合并败血症。