细菌性和阿米巴性痢疾属于我国法定管理的乙类传染病，痢疾在世界范围内引起的发病率和死亡率居腹泻病之首位，其中主要是细菌性痢疾，其中主要是细菌性痢疾。发展中国家发病率较高，可达1000/10万以上，而发达国家发病率水平相对较低，可少至0.3/10万。菌痢是我国夏秋季最常见的急性肠道传染病。其流行范围广，传播快，发病率高，对人类健康危害大，特别是洪涝灾害地区，一旦水源污染，更容易发生和蔓延菌痢。
痢疾的传染源是腹泻病人、亚临床病人和病原携带者。动物中唯有灵长类的猿猴、猩猩可感染痢疾杆菌，由于猿猴、猩猩不可能与人类有广泛的密切接触，所以在菌痢的流行病学上意义不大。
